עבודת הביקורת
יחידת הביקורת באגף החשב הכללי אחראית לביקורת הפנימית על ביצוע תקציב המדינה ביחידות החשבות והכספים של משרדי הממשלה. היחידה פועלת מתוקף חוק הביקורת הפנימית (התשנ"ב 1992).

היחידה בודקת פעולות המתבצעות ביחידות הכספים של משרדי הממשלה לאור כללי המנהל התקין, הוראת החוק ונהלים רלוונטיים, וכן בהיבטים של חיסכון ויעילות בניהול הפעילות הכספית. עבודת הביקורת כוללת ביקורות שוטפות וביקורות עומק על פי תוכנית עבודה וכן ביקורות מיוחדות על פי דרישה, כמפורט להלן:

ביקורות שוטפות
ביקורות שוטפות מבוצעות על פי תוכנית עבודה ומורכבות מהפרקים הבאים:

1) מבנה החשבות: סקירה של הפעילות במחלקות הכפופות לחשב (מחלקות השכר, התשלומים, הנהלת החשבונות, ההכנסות ועוד). במהלך הסקירה נבדקת הפרדת התפקידים בין המחלקות, וכן נבחנת תקינותן של ההרשאות שניתנו לעובדים לבצע פעולות במערכת הכספית.

2) הנהלת חשבונות: סקירת נושא התשלומים, הכוללת בדיקה מדגמית של הטיפול בדרישות תשלום, האסמכתאות המתאימות והקפדה על אשראי ספקים ועוד. בנוסף, נבדקים ניהול המוטבים (רישום מוטבים, בדיקת האישורים הנדרשים מהמוטבים, מוטבים כפולים, חסימת מוטבים וכדומה), ניהול ההתחייבויות (רישום ההתחייבויות טרם ביצוע התשלום ובמועד הרכישה/ההתקשרות), וכן נבדקות קופות הביטחון ואבטחת הטפסים הכספיים.

3) התאמות בנקים: בדיקת חשבונות הבנק של המשרד (הרשאות חתימה בחשבון, מצב החשבון, הפרדה בין חשבון הוצאות להכנסות) וביצוע התאמות הבנקים.

4) קופות קטנות: בדיקת ניהול הקופות הקטנות (מצב החשבון בקופה הקטנה, מהות הרכישות ששולמו מהקופה הקטנה, עמידה במקסימום המותר לרכישה חד פעמית).

5) שכר: בדיקת נושאי שכר כגון: דיווח שעות נוכחות, תשלום שעות נוספות, תשלום אש"ל, תשלום על כוננויות, קצובות נסיעה, לימודים והשתלמויות, תשלום אגרות מקצועיות, תקני רכב, לינות בבתי מלון , ביצוע זקיפות הטבה ועוד.

6) מכרזים: בדיקה של  יישום חוק חובת המכרזים ותקנותיו  לגבי התקשרויות משרדי הממשלה.

7) יועצים: בדיקה של אופן בחירת היועצים ותקינות התשלום ליועצים לרבות דיווחי שעות הייעוץ, הוצאות הנסיעה והוצאות נלוות אחרות בהתאם לחוזרי חשכ"ל.

8) פיקוח תקציבי: ניתוח של ביצוע התקציב, ובדיקה כי השימוש בתקנה תקציבית הינו רק בגין הוצאות התואמות את מהות התקנה. במסגרת הניתוח, מאותרות חריגות ממסגרת התקציב ונבדקת העברה של הוצאות מתקנות שבהן יש תת ביצוע לתקנות שבהן יש ביצוע יתר. בנוסף, נבדקת הבקרה התקציבית, ההקפדה על רישום הכנסות בתקנה התקציבית המתאימה ועוד.

9) נסיעות לחו"ל: בחינת הליך האישור של נסיעות עובדים לחו"ל וקיום ועדת נסיעות משרדית. בנוסף, נבדקים הליכי רכישת כרטיסי הטיסה, תשלומי האש"ל והלינה ששולמו בגין הנסיעות לחו"ל, והתאמתם לתעריפים ולכללי הזכאות שנקבעו בתקשי"ר ובחוזרי חשכ"ל.

10) רכבי איגום: בדיקת האישורים לשימוש ברכבים, זקיפת הטבה בגין שימוש ברכב צמוד ורכבי איגום בהתאם לחוקי המס והוראות החשכ"ל, ומעקב למניעת ביצוע נסיעות פרטיות ברכבי האיגום (למשל בסופי שבוע, בחגים ועוד).   

11) מכשירי רט"ן: בדיקת תקינות המינוי של ועדת הרט"נים והתאמת הפרמטרים לפיהם מאשרת הועדה הצמדת רט"ן לעובד, בהתאם להוראות התכ"ם וחוזרי החשכ"ל בנושא. וידוא חתימת חשב על הקצאת רט"ן לעובד, תקינות התשלומים והתאמתם לחוזרי חשכ"ל ועוד.

ביקורות עומק
ביקורות העומק הנערכות על פי תוכנית העבודה נועדו לבחון בצורה מעמיקה נושאים ספציפיים הייחודיים לחשבות המבוקרת.
בין היתר, ערכה היחידה את ביקורות העומק הבאות:
• העסקת עובדי מחשוב
• תשלום גמלאות בשירות בתי הסוהר
• זכאי סבסוד למעונות יום
• תשלומי מענקים ותמיכות

ביקורות מיוחדות
ביקורות מיוחדות מתבצעות על פי דרישה ספציפית של החשב הכללי, סגניו או החשבים במשרדי הממשלה עצמם.
בין היתר, ערכה היחידה את הביקורות המיוחדות הבאות:
• הסעות תלמידים בחינוך העצמאי
• התנהלות החברה הממשלתית לתיירות (חמ"ת)
• אישור "דמי חכירה סמליים" לעמותות
• מערך האבטחה בתחבורה הציבורית
• מערכת ה-GIS - מערכת דיגיטלית לקביעת מרחקי דרכים, המשמשת את משרד החינוך לקביעת זכאות תלמידים לסבסוד היסעים.

מבקרי הכספים בחשבויות
עבודת מבקרי הכספים בחשבויות משרדי הממשלה מוסדרת בחוזר הוראת שעה כספי 2006-1-8. בהתאם להוראה, יועסק מבקר כספים בכל חשבות. המבקר יפעל על פי הנחיית חשב המשרד ובהתאם להוראות התכ"ם, ובהנחיה מקצועית של מנהל יחידת הביקורת של החשב הכללי.

יחידת הביקורת עורכת מעקב אחר העסקת מבקרי הכספים בחשבויות. כמו כן, במהלך השנה עולים ליקויים שונים, בעקבות ביקורות שבוצעו ביחידת הביקורת ובעקבות נושאים שונים העולים במטה החשכ"ל, אשר יש עניין לבחון אותם באופן רוחבי בחשבויות המשרדים. לאור זאת, אחת לשנה, לקראת כתיבת תוכנית העבודה של מבקרי הכספים בחשבות, מוציאה יחידת הביקורת חוזר ובו דגשים שיש לכלול בתוכנית. בנוסף, עורכת יחידת הביקורת מעקב אחר כתיבת תוכניות העבודה, ביצוען והפעולות הננקטות לטיפול בליקויים שעלו מהדו"חות.